Les sires de Chepoix eurent une importante forteresse au village pendant le Moyen Âge était en ruine en 1431 et a été détruite sur ordre de Charles VII, dont il ne reste malheureusement rien. Elle aurait été remplacée par un autre édifice au hameau de Warmaise, qui existait encore en 1862 et était flanqué de deux tours.
Au Moyen Âge toujours, la paroisse dépendait de la commanderie d’Ivry-le-Temple de l'ordre de Malte.
Selon Louis Graves, « Chepoix avait de l'importance ou moyen-âge. Philippe-le-bel exempta les habitons des subsides qu'il leva sur le royaume à son avènement au trône, à cause des terres dont il était possesseur sur leur territoire, en compagnie de religieux qu'on croit être des templiers ».
L'église médiévale est détruite pendant la Guerre de Cent Ans.
La commune de Bacouël a été détachée de celle de Chepoix par une loi du 19 juin 1865.

La famille de Chepoix, d'ancienne chevalerie (souvent dite de Sépoix), originaire du Santerre, eut des alliances avec les Coucy, Lannoy, Ongnies, Renty, Rubempré, Saveuse, etc. :
Thibaut, sire de Chepoix, amiral, nommé en 1304 grand-maître des arbalétriers de France, rendit de grands services à Philippe le Bel. Il remplit la charge d'amiral de la mer dans l'expédition de Romanie de 1306 à 1308 (montée par Philippe le Bel et son frère Charles de Valois en vue de conquérir l'empire de Constantinople auquel ce dernier prétendait depuis son union en 1302 avec Catherine de Courtenay) et recevait en cette qualité trente sols par jour d'émoluments.
Jean Ier acquit vers 1311 Crouy et Houssoy sur Charles de Valois.
Jean II de Chepoix commanda les galères que Philippe de Valois envoya contre les Turcs en 1334.
Louis de Chepoix mourut lors de la bataille d'Azincourt.
Charles de Chepoix devint chambellan de Louis XII.
Méry de Chepoix fut fait chevalier par François I à la bataille de Marignan. Il mourut vice-amiral de Bretagne.
Cette illustre maison s'éteignit par la mort de Robert de Chepoix, gouverneur de Saint-Quentin et bailli du Valois, à la fin du XVie siècle.
Les Boulainvilliers, dont Perceval et Henri, furent aussi seigneurs de Chepoix.

Les armes de Chepoix se blasonnent ainsi :
d'or, à cinq châteaux maçonnés de sable. les tourelles et portails de gueules, 2, 2 et 1.
Le blason du village de Chepoix, visible sur la tour du clocher de l'église Saint-Léger, est celui de la famille de Chepoix.